Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms