Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms