Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms