Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms