Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMC4Q9NTJ3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMC4Q9NTJ3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMC4Q9NTJ3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms