Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms