Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPRSS4Q9NRS4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms