Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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