Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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