Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2203.7 ms