Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL11BQ9C0K0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL11BQ9C0K0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL11BQ9C0K0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL11BQ9C0K0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL11BQ9C0K0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL11BQ9C0K0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL11BQ9C0K0 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL11BQ9C0K0 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL11BQ9C0K0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL11BQ9C0K0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL11BQ9C0K0 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL11BQ9C0K0 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL11BQ9C0K0 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL11BQ9C0K0 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL11BQ9C0K0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL11BQ9C0K0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL11BQ9C0K0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL11BQ9C0K0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL11BQ9C0K0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL11BQ9C0K0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL11BQ9C0K0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL11BQ9C0K0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL11BQ9C0K0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL11BQ9C0K0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL11BQ9C0K0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL11BQ9C0K0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL11BQ9C0K0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL11BQ9C0K0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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