Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms