Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms