Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms