Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms