Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms