Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms