Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms