Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms