Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms