Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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UPK3BQ9BT76 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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