Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMM29Q9BSF4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms