Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A3Q9BRY0 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms