Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3R4Q99570 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms