Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms