Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms