Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms