Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOLD1Q96LR9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOLD1Q96LR9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOLD1Q96LR9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOLD1Q96LR9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOLD1Q96LR9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOLD1Q96LR9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOLD1Q96LR9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOLD1Q96LR9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOLD1Q96LR9 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOLD1Q96LR9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOLD1Q96LR9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOLD1Q96LR9 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOLD1Q96LR9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOLD1Q96LR9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOLD1Q96LR9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOLD1Q96LR9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOLD1Q96LR9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOLD1Q96LR9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOLD1Q96LR9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOLD1Q96LR9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOLD1Q96LR9 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOLD1Q96LR9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOLD1Q96LR9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOLD1Q96LR9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOLD1Q96LR9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOLD1Q96LR9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms