Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP47Q96K76 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP47Q96K76 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms