Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HIC2Q96JB3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms