Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms