Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SPTSSAQ969W0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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SPTSSAQ969W0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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SPTSSAQ969W0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SPTSSAQ969W0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SPTSSAQ969W0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SPTSSAQ969W0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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SPTSSAQ969W0 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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