Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms