Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAVIN3Q969G5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms