Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTC9Q92623 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms