Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms