Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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