Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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