Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms