Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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