Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms