Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.063e-9■■■■■ 28.3
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PRPF8Q6P2Q9 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 28.2
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PRPF8Q6P2Q9 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.234e-7■■■■■ 28.2
PRPF8Q6P2Q9 NEDD4L-203ENST00000357895 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.254e-7■■■■■ 28.2
PRPF8Q6P2Q9 NEDD4L-214ENST00000586263 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.334e-7■■■■■ 28.2
PRPF8Q6P2Q9 NEDD4L-207ENST00000435432 3417 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.474e-7■■■■■ 28.2
PRPF8Q6P2Q9 FN1-221ENST00000480737 384 ntTSL 21.74□□□□□ -2.132e-30■■■■■ 28.2
PRPF8Q6P2Q9 ENTPD5-201ENST00000334696 5842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.384e-10■■■■■ 28.2
PRPF8Q6P2Q9 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.524e-10■■■■■ 28.2
PRPF8Q6P2Q9 PPIL4-201ENST00000253329 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.12e-8■■■■■ 28.2
PRPF8Q6P2Q9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.263e-9■■■■■ 28.2
PRPF8Q6P2Q9 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.563e-9■■■■■ 28.2
PRPF8Q6P2Q9 SLC35E2B-201ENST00000480991 2860 ntTSL 210.99□□□□□ -0.653e-9■■■■■ 28.2
PRPF8Q6P2Q9 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.673e-9■■■■■ 28.2
PRPF8Q6P2Q9 MYH10-210ENST00000488329 538 ntTSL 28.92□□□□□ -0.986e-8■■■■■ 28.2
PRPF8Q6P2Q9 STAT5B-204ENST00000468496 897 ntTSL 55.39□□□□□ -1.552e-8■■■■■ 28.2
PRPF8Q6P2Q9 DMAP1-215ENST00000494092 681 ntTSL 314.35□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 28.2
PRPF8Q6P2Q9 PCID2-204ENST00000375459 1668 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.046e-7■■■■■ 28.2
PRPF8Q6P2Q9 C15orf38-AP3S2-203ENST00000559629 675 ntTSL 314.49□□□□□ -0.099e-12■■■■■ 28.2
PRPF8Q6P2Q9 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.349e-12■■■■■ 28.2
PRPF8Q6P2Q9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.479e-12■■■■■ 28.2
PRPF8Q6P2Q9 C15orf38-AP3S2-204ENST00000560224 659 ntTSL 211.69□□□□□ -0.549e-12■■■■■ 28.2
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