Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CARMIL2Q6F5E8 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms