Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms