Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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C9orf135Q5VTT2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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C9orf135Q5VTT2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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C9orf135Q5VTT2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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C9orf135Q5VTT2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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C9orf135Q5VTT2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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C9orf135Q5VTT2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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C9orf135Q5VTT2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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C9orf135Q5VTT2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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C9orf135Q5VTT2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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C9orf135Q5VTT2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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C9orf135Q5VTT2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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C9orf135Q5VTT2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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