Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf38Q5JPI3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf38Q5JPI3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf38Q5JPI3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf38Q5JPI3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf38Q5JPI3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf38Q5JPI3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf38Q5JPI3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf38Q5JPI3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf38Q5JPI3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf38Q5JPI3 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf38Q5JPI3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf38Q5JPI3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf38Q5JPI3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf38Q5JPI3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf38Q5JPI3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf38Q5JPI3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf38Q5JPI3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf38Q5JPI3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf38Q5JPI3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf38Q5JPI3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf38Q5JPI3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf38Q5JPI3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf38Q5JPI3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf38Q5JPI3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf38Q5JPI3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf38Q5JPI3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf38Q5JPI3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf38Q5JPI3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms