Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms