Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED5Q49AG3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms