Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms