Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V8

BSX, Brain-specific homeobox protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSXQ3C1V8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BSXQ3C1V8 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms